Pada hari ini saya akan posting
tugas ujian akhir semesteran dengan tema “ aquaculture bioinformatic”.
Jurnal ini dalam bentuk bahasa
inggris, sehingga harus ditranslatekan terlebih dahulu.
Untuk mengunduh jurnal tersebut,
Anda dapat klik alamat di bawah ini :
Resume
jurnal tersebut saya buat dalam bahasa Indonesia agar mudah dipahami.
Di bawah
ini merupakan resume jurnal tersebut:
Identification and analysis of immune-related transcriptome in Asian seabass Lates calcarifer.
Penyakit ikan yang disebabkan oleh virus, bakteri dan
parasit
diakui sebagai
hambatan yang signifikan terhadap produksi perikanan budidaya dan perdagangan
sehingga mempengaruhi ekonomi serius. Perkiraan kerugian global penyakit pada budidaya melampaui US $
9 miliar per tahun, yaitu sekitar 15% dari nilai ikan
dunia ternak
dan produksi
kerang. Sistem kekebalan
bawaan cukup penting
dalam ikan dan diyakini menjadi baris pertama pertahanan tuan
rumah dalam menentang organisme patogen atau bahan asing
lainnya. Dalam
akuakultur, dasar data yang pada ikan-patogen interaksi telah efektif diterapkan
untuk vaksinasi skala besar untuk membantu generasi respon imun
yang kuat dan tahan lama.
Namun, pengembangan
vaksin yang efektif adalah kompleks proses. Prasyarat untuk mengembangkan
vaksin adalah
pemahaman epidemiologi
penyakit dan dasar
sistem
kekebalan tubuh spesies sasaran dan mengidentifikasi gen dan jalur
yang terlibat dalam respon transkrip ikan terhadap infeksi. skrining untuk kekebalan terkait gen dalam
database EST menggunakan alat bioinformatic memungkinkan identifikasi
gen yang hanya urutan berbagi kesamaan dengan diketahui kekebalan terkait protein dari organisme lain,
tapi rindu gen baru yang berhubungan dengan respon imun. Teknik
supresi subtraktif hibridisasi (SSH) dapat diterapkan untuk mengidentifikasi
diferensial
gen
diekspresikan pada jaringan yang berbeda atau kondisi dan dengan demikian
juga merupakan metode sangat efektif untuk mengidentifikasi baru gen yang
berhubungan dengan proses biologi penting. Teknik ini telah terbukti menjadi alat yang cocok untuk
identifikasi
dari novel
kekebalan-gen terkait dalam berbagai teleost spesies ikan, termasuk ikan flounder dan salmon.
Para Seabass Asia Lates calcarifer didistribusikan di daerah tropis
dan sub-tropis di Asia adalah penting foodfish laut spesies di Asia Tenggara dan Australia. Spesies ini
telah dibudidayakan selama lebih dari 20 tahun di payau air kolam
dan dalam beberapa tahun terakhir dalam mengambang kandang.
Produksi tahunan global di Asia Seabass saat ini 400.000 metrik ton menurut FAO statistik. Dalam rangka
untuk melindungi kerugian akuakultur oleh patogen penyakit,
Seabass Asia akuakultur segera memerlukan strategi yang efektif pencegahan penyakit.
Meskipun
beberapa studi
telah menunjukkan bahwa Seabass Asia dipamerkan respon
kekebalan tubuh yang kuat terhadap bakteri berdasarkan kegiatan
antibodi dalam serum informasi, sedikit pada host-Patogen interaksi selama
infeksi dengan patogen
mikroorganisme
yang tersedia untuk spesies ini. Respon imun dapat dirangsang oleh eksperimen bakteri
lipopolisakarida (LPS). perpustakaan cDNA hati, ginjal dan limpa telah terbukti menjadi sangat baik sumber
informasi genetik tentang fungsi kekebalan pada ikan.
Sekian
resume jurnal saya,,
Semoga
dapat bermanfaat,,,
C U ….
Terima
kasih