Pada hari ini saya akan posting tugas ujian akhir semesteran dengan tema “ aquaculture bioinformatic”.

Jurnal ini dalam bentuk bahasa inggris, sehingga harus ditranslatekan terlebih dahulu.

Untuk mengunduh jurnal tersebut, Anda dapat klik alamat di bawah ini :

http://www.biomedcentral.com/1471-2164/11/356

Resume jurnal tersebut saya buat dalam bahasa Indonesia agar mudah dipahami.

Di bawah ini merupakan resume jurnal tersebut:

Identification and analysis of immune-related transcriptome in Asian seabass Lates calcarifer.

Penyakit ikan  yang disebabkan oleh virus, bakteri dan parasit diakui sebagai hambatan yang signifikan terhadap produksi perikanan budidaya dan perdagangan sehingga mempengaruhi ekonomi serius. Perkiraan kerugian global penyakit pada budidaya melampaui US $ 9 miliar per tahun, yaitu sekitar 15% dari nilai ikan dunia ternak dan produksi kerang. Sistem kekebalan bawaan cukup penting dalam ikan dan diyakini menjadi baris pertama pertahanan tuan rumah dalam menentang organisme patogen atau bahan asing lainnya. Dalam akuakultur, dasar data yang pada ikan-patogen interaksi telah efektif diterapkan untuk vaksinasi skala besar untuk membantu generasi respon imun yang kuat dan tahan lama. Namun, pengembangan vaksin yang efektif adalah kompleks proses. Prasyarat untuk mengembangkan vaksin adalah pemahaman epidemiologi penyakit dan dasar sistem kekebalan tubuh spesies sasaran dan mengidentifikasi gen dan jalur yang terlibat dalam respon transkrip ikan terhadap infeksi. skrining untuk kekebalan terkait gen dalam database EST menggunakan alat bioinformatic memungkinkan identifikasi gen yang hanya urutan berbagi kesamaan dengan diketahui kekebalan terkait protein dari organisme lain, tapi rindu gen baru yang berhubungan dengan respon imun. Teknik supresi subtraktif hibridisasi (SSH) dapat diterapkan untuk mengidentifikasi diferensial gen diekspresikan pada jaringan yang berbeda atau kondisi dan dengan demikian juga merupakan metode sangat efektif untuk mengidentifikasi baru gen yang berhubungan dengan proses biologi penting. Teknik ini telah terbukti menjadi alat yang cocok untuk identifikasi dari novel kekebalan-gen terkait dalam berbagai teleost spesies ikan, termasuk ikan flounder dan salmon.

Para Seabass Asia Lates calcarifer didistribusikan di daerah tropis dan sub-tropis di Asia adalah penting foodfish laut spesies di Asia Tenggara dan Australia. Spesies ini telah dibudidayakan selama lebih dari 20 tahun di payau air kolam dan dalam beberapa tahun terakhir dalam mengambang kandang. Produksi tahunan global di Asia Seabass saat ini 400.000 metrik ton menurut FAO statistik. Dalam rangka untuk melindungi kerugian akuakultur oleh patogen penyakit, Seabass Asia akuakultur segera memerlukan strategi yang efektif pencegahan penyakit. Meskipun beberapa studi telah menunjukkan bahwa Seabass Asia dipamerkan respon kekebalan tubuh yang kuat terhadap bakteri berdasarkan kegiatan antibodi dalam serum informasi, sedikit pada host-Patogen interaksi selama infeksi dengan patogen mikroorganisme yang tersedia untuk spesies ini. Respon imun dapat dirangsang oleh eksperimen bakteri lipopolisakarida (LPS). perpustakaan cDNA hati, ginjal dan limpa telah terbukti menjadi sangat baik sumber informasi genetik tentang fungsi kekebalan pada ikan.

Sekian resume jurnal saya,,

Semoga dapat bermanfaat,,,

C U ….

Terima kasih